Tras la integración en el año 2010 de Bancaja en Bankia, la abultada deuda valencianista pasó a ser con esta nueva entidad: Bankia. Magallanes iniciaría ese año su escalada triunfal hacia la Primera División. El club culmina una temporada 2011/12 con buenos resultados deportivos: es de nuevo 3º en la Liga, semifinalista en Copa del Rey ante el Barcelona (tras haber superado a Cádiz, Sevilla y Levante) y en la Europa League ante el Atlético de Madrid, tras haber sido eliminado previamente de la fase de grupos de la Liga de Campeones siendo superado por el Bayer Leverkusen.
